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Die Internationale Union für Naturschutz (IUCN) stuft sie als „nicht gefährdet“ ein und räumt ihnen daher eine geringere Forschungspriorität ein.
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Jaguarundis leiden jedoch unter Lebensraumzerschneidung und -verlust. Ihr Status könnte sich nach der Neubewertung durch die IUCN ändern, und die Art könnte gefährdet sein, was den Bedarf an weiterer Forschung unterstreicht.